承德如何设计实验检测DNA各组分(基础技术指南,适合初学者)

发布时间:2024-05-06 文章来源:安康生物

承德如何设计实验检测DNA各组分(基础技术指南,适合初学者)

一、dna实验步骤

DNA检测可以通过多种技术进行,包括PCR、DNA芯片、测序等。详情如下:

一、测序:测序技术可以将DNA序列信息获取出来,特别适用于未知基因或基因组的研究。常见的测序方法包括Sanger测序和下一代测序(NGS)。具体操作包括以下几个步骤:

1、DNA片段制备:将待测DNA进行片段化处理。

2、清洁和纯化:对DNA片段进行清洁和纯化,去除杂质。

3、测序反应:将片段化的DNA与引物进行反应,通过添加适当的酶和核苷酸,使得DNA逐渐合成新链,并产生荧光信。

4、信读取和序列分析:通过测序仪器读取荧光信,并将其转化为DNA序列信息。随后,对得到的序列信息进行比对和分析,以获得准确的DNA序列。

二、PCR:PCR(聚合酶链式反应)是将少量DNA扩增为大量的技术,可以用于检测某些基因突变、DNA损伤等。具体操作包括以下几个步骤:

1、提取DNA:从样本中提取出待检测的DNA。

2、设计引物:根据目标基因的序列设计引物,引物是一对短链DNA片段,用于定位和扩增目标基因。

3、进行PCR扩增:将待检测的DNA与引物一起加入PCR反应体系中,通过多次循环的温度变化,使得目标DNA片段被扩增成大量可检测的DNA产物。

4、检测PCR产物:通过电泳等方法,将PCR产物进行分析和检测,从而确定目标基因是否存在突变或损伤。

三、DNA芯片:DNA芯片是一种高通量的基因检测技术。它基于DNA探针和待检测样本之间的互补配对原理,通过比较样本和探针上的DNA序列匹配程度来检测样本的基因型。具体操作包括以下几个步骤:

1、制备DNA芯片:在玻璃或硅片上连接数万到数百万个DNA探针。

2、样本处理:将待检测的DNA样本进行预处理,如放大、标记等。

3、杂交反应:将样本与DNA芯片上的探针进行杂交反应,形成特异的DNA双链结构。

4、检测信:通过读取芯片上的荧光信或其他信,分析和比较样本与探针之间的匹配程度,从而确定样本的基因型。

除了以上方法,还可以通过血液检查进行DNA检测。血液样本中含有白细胞,其中包括核细胞,这些细胞中含有DNA。通过提取白细胞,然后进行相应的PCR、芯片或测序技术

二、dna组分鉴定实验

1、DNA的分离提取及含量测定,一、实验目的,掌握从动物组织中提取DNA的方法 学习二苯胺法测定DNA含量的原理和方法,二、实验原理,取材原则:DNA含量高(新鲜),DNA酶活性低 实验条件:避免机械振荡;防止过酸、过碱对磷酸二酯键的破坏;抑制核酸酶:柠檬酸钠、EDTA;SDS 分离与纯化的方法一般包括细胞裂解、酶处理、核酸与其他生物大分子物质分离、核酸纯化等几个主要步骤,4、 大量组织样本DNA提取,组织匀浆:裂解细胞 离心获得核酸-蛋白复合物 SDS:破坏细胞膜、核膜;分离组织蛋白与DNA 改变盐浓度分离DNA与RNA: 0.15mol/L NaCl 沉淀DNP, 1mol / L NaCl溶

2、解DNP。 氯仿-异戊醇振荡抽提去除蛋白质 离心分离水相(DNA)与有机相 乙醇沉淀DNA,真核细胞DNA与蛋白质结合成核蛋白(DNP),RNA与蛋白质结合成RNP,可利用DNP和RNP在不同浓度NaCl中溶解度的不同来分离DNP和RNP,DNP相 对 溶 解 度,NaCl(mol/L,盐浓度对核蛋白溶解度的影响,氯仿去除蛋白质,氯仿非极性分子,水极性分子;蛋白水溶液与氯仿混合蛋白失水变性。 离心变性蛋白质的密度比水的密度为大沉淀在水相下面,与溶解在水相中DNA分离。 异戊酵(氯仿:异戊醇=24:1):剧烈振荡降低分子表面张力,所以能减少抽提过程中的泡沫产生(混合液内产生气泡;气泡阻止相互间充

3、分作用),乙醇沉淀DNA(脱水,5、 小量组织/细胞样品中DNA的制备试剂盒,6、 DNA含量的测定二苯胺法,722分光光度计检测 二茉胺法灵敏度不高,样品中DNA含量50g/ml,核酸含量的测定方法,核酸是由磷酸、戊糖、碱基所组成的核苷酸的多聚高分子。三者以等分子数而存在,所以只要测定三者中任何一处成分的含量,就可推算出核酸的含量。常用的核酸测定方法有 : 紫外吸收法 、定磷法、定糖法 RNA的定量测定:地衣酚法核糖 DNA的定量测定:二苯胺法脱氧糖 钼蓝法定磷,紫外吸收法中DNA或RNA的定量,A260=1.0相当于: 50g/ml双链DNA 40g/ml单链DNA(或RNA) 20g/m

4、l寡核苷酸,可见光谱:380780nm,分光光度计,比色杯,石英比色杯:3ml, 50-100L,Biophotometer,一次性比色杯;50L样品,Nanophotometer (徳,Single and multi wavelength measurement bined with kinetic methods。 The full wavelength scan (190 nm - 1100 nm) allows curve interpretation for attainment of more detailed scientific knowledge over whole

5、 spectrum。 sample size as low as 0.5uL(2ng/ul 18750 ng/ul dsDNA)。,Thermo Scientific NanoDrop 2000c(March 2, 2009,Thermo Scientific NanoDrop 2000 and 2000c Spectrophotometers。 These easy-to-use, UV-Vis instruments enable a 5-second measurement time of DNA, RNA and proteins on a sample size as low as

6、0.5uL,三、实验操作,兔肝200g/班,去脂,剪碎 ml冷1xSSC,5,2-3次 ml冷1xSSC(0.15MNaCl-柠檬酸钠)匀浆1-2 15-20ml匀浆液/组(记录实际体积) 离心:6000rpm,4,15 记录上清体积,1、兔肝组织DNA的提取,沉淀 + 5V 0.15mol/L NaCl-0.1mol/LNa2EDTA 搅拌,滴加5%SDS1% 搅拌,加固体NaCl 1mol/L 搅拌30 NaCl 全溶 等V氯仿/异戊醇(24:1),振荡20 离心:6000rpm,4,15,水相(含DNA钠盐,蛋白凝胶,有机相,转移水相150ml烧杯 搅动,加2V冷95%乙醇

7、沉淀DNA 70%乙醇,2(10ml)除盐 95%乙醇,2 (10ml)脱水 100%乙醇,2 (10ml)脱水 吹干 3ml蒸馏水溶解DNA,2、 绘制 DNA的标准工作曲线,样品稀释,向1-6管中加入4ml二苯胺试剂,混合均匀。 将上述各管放入沸水浴中精确反应10、冷却。 595nm波长下测每管的吸收值。 将各管在595nm下的吸收值对加人的DNA的g数作图,应得一条通过零点的直线,3、兔肝DNA样品中DNA含量的测定,2ml(不同稀释度)免肝DNA溶液+ 4ml二苯胺试剂 沸水浴中精确加热10、冷却 用管1做空白对照测该管在595nrn下的光吸收值。根据DNA的标准工作曲线,计算所制备的DNA样品中的DNA含量,4、 实验结果计算DAN产率,DNA含量/毫升待测液=标准曲线查得值稀释倍数 =xxg / ml,思 考 题,肝细胞的匀浆液(含0.5mol/L氯化钠-0.0l5mol/L柠檬酸钠,pH7.0)经离心为什么保留沉淀而不要上清液?为什么提取液

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